Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMCO5BA8MYB1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCO5BA8MYB1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMCO5BA8MYB1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMCO5BA8MYB1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMCO5BA8MYB1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMCO5BA8MYB1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms