Protein–RNA interactions for Protein: A8MV24

C17orf98, Uncharacterized protein C17orf98, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf98A8MV24 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C17orf98A8MV24 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf98A8MV24 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf98A8MV24 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C17orf98A8MV24 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C17orf98A8MV24 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C17orf98A8MV24 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf98A8MV24 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
C17orf98A8MV24 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C17orf98A8MV24 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C17orf98A8MV24 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms