Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDR42E2A6NKP2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDR42E2A6NKP2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDR42E2A6NKP2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDR42E2A6NKP2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDR42E2A6NKP2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDR42E2A6NKP2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDR42E2A6NKP2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDR42E2A6NKP2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDR42E2A6NKP2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDR42E2A6NKP2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDR42E2A6NKP2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDR42E2A6NKP2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms