Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TVP23AA6NH52 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TVP23AA6NH52 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TVP23AA6NH52 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TVP23AA6NH52 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TVP23AA6NH52 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TVP23AA6NH52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TVP23AA6NH52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TVP23AA6NH52 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TVP23AA6NH52 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TVP23AA6NH52 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TVP23AA6NH52 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TVP23AA6NH52 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TVP23AA6NH52 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TVP23AA6NH52 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TVP23AA6NH52 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms