Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA8A3KMH1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA8A3KMH1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA8A3KMH1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWA8A3KMH1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWA8A3KMH1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWA8A3KMH1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWA8A3KMH1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWA8A3KMH1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWA8A3KMH1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWA8A3KMH1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWA8A3KMH1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA8A3KMH1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA8A3KMH1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA8A3KMH1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA8A3KMH1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWA8A3KMH1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VWA8A3KMH1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA8A3KMH1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA8A3KMH1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA8A3KMH1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA8A3KMH1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VWA8A3KMH1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VWA8A3KMH1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VWA8A3KMH1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VWA8A3KMH1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VWA8A3KMH1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VWA8A3KMH1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA8A3KMH1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA8A3KMH1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA8A3KMH1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA8A3KMH1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA8A3KMH1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA8A3KMH1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWA8A3KMH1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWA8A3KMH1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWA8A3KMH1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWA8A3KMH1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VWA8A3KMH1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VWA8A3KMH1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VWA8A3KMH1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VWA8A3KMH1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA8A3KMH1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA8A3KMH1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWA8A3KMH1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA8A3KMH1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA8A3KMH1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA8A3KMH1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA8A3KMH1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWA8A3KMH1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWA8A3KMH1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWA8A3KMH1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VWA8A3KMH1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.51■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
VWA8A3KMH1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms