Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX44

TRBV5-5, T-cell receptor beta variable 5-5 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-5A0A0J9YX44 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV5-5A0A0J9YX44 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV5-5A0A0J9YX44 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV5-5A0A0J9YX44 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV5-5A0A0J9YX44 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV5-5A0A0J9YX44 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms