Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
A0A087WWV3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
A0A087WWV3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
A0A087WWV3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
A0A087WWV3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
A0A087WWV3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A087WWV3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A087WWV3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A087WWV3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A087WWV3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A087WWV3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A087WWV3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A087WWV3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A087WWV3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A087WWV3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
A0A087WWV3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
A0A087WWV3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
A0A087WWV3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
A0A087WWV3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
A0A087WWV3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A087WWV3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A087WWV3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
A0A087WWV3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
A0A087WWV3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
A0A087WWV3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
A0A087WWV3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
A0A087WWV3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
A0A087WWV3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
A0A087WWV3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
A0A087WWV3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A087WWV3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A087WWV3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A087WWV3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A087WWV3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A087WWV3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A087WWV3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms