Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUJ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087WUJ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087WUJ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WUJ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms