Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6U6

TRAV8-7, T-cell receptor alpha variable 8-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV8-7A0A075B6U6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAV8-7A0A075B6U6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAV8-7A0A075B6U6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAV8-7A0A075B6U6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAV8-7A0A075B6U6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAV8-7A0A075B6U6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAV8-7A0A075B6U6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAV8-7A0A075B6U6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAV8-7A0A075B6U6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAV8-7A0A075B6U6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAV8-7A0A075B6U6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV8-7A0A075B6U6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV8-7A0A075B6U6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV8-7A0A075B6U6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms