Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
HIF1AQ16665 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms