Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD1Q15797 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD1Q15797 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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