Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEC24CP53992 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms