Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB1P53618 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB1P53618 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB1P53618 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB1P53618 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB1P53618 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB1P53618 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB1P53618 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB1P53618 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPB1P53618 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPB1P53618 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPB1P53618 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPB1P53618 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPB1P53618 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPB1P53618 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPB1P53618 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPB1P53618 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COPB1P53618 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COPB1P53618 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPB1P53618 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPB1P53618 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPB1P53618 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPB1P53618 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPB1P53618 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPB1P53618 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPB1P53618 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPB1P53618 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPB1P53618 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPB1P53618 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPB1P53618 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPB1P53618 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPB1P53618 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPB1P53618 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPB1P53618 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPB1P53618 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPB1P53618 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COPB1P53618 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPB1P53618 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms