Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
J3KRW8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
J3KRW8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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