Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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