Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRRC63Q05C16 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC63Q05C16 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms