Protein–RNA interactions for Protein: P23508

MCC, Colorectal mutant cancer protein, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCP23508 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCCP23508 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCCP23508 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCP23508 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCP23508 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCP23508 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCP23508 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCP23508 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCP23508 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCP23508 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCP23508 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCP23508 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCP23508 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCP23508 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCP23508 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms