Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NECAP2Q9NVZ3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms