Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PFDN5Q99471 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms