Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2X4

PID1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PID1Q7Z2X4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PID1Q7Z2X4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PID1Q7Z2X4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms