Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 LCD1YDR499W 2244 nt1.46□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 NOC3YLR002C 1992 nt1.45□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 EMC5YIL027C 426 nt1.45□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.45□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 KAP122YGL016W 3246 nt1.44□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 SMC4YLR086W 4257 nt1.44□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 RPL34BYIL052C 366 nt1.44□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 COF1YLL050C 432 nt1.44□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 RPL33BYOR234C 324 nt1.44□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 NUT1YGL151W 3399 nt1.44□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.43□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 ALK1YGL021W 2283 nt1.43□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 KIP1YBL063W 3336 nt1.43□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 RAD50YNL250W 3939 nt1.43□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 YPR117WYPR117W 7470 nt1.43□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 YLR140WYLR140W 327 nt1.42□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 UFD2YDL190C 2886 nt1.42□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 VIK1YPL253C 1944 nt1.42□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 BST1YFL025C 3090 nt1.41□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 YGL217CYGL217C 342 nt1.41□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 YOR015WYOR015W 360 nt1.41□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 COG4YPR105C 2586 nt1.41□□□□□ -2.18
LSP1Q12230 HMRA2YCR096C 360 nt1.4□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.4□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.4□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 CSE2YNR010W 450 nt1.4□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 snR14snR14 160 nt1.4□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 SLX4YLR135W 2247 nt1.39□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 SPO21YOL091W 1830 nt1.39□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.39□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.39□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.39□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.39□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.39□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.39□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.39□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YJL015CYJL015C 285 nt1.39□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 RSM22YKL155C 1887 nt1.39□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 NCA2YPR155C 1851 nt1.38□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YDR366CYDR366C 399 nt1.38□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YJL120WYJL120W 324 nt1.38□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 VPS55YJR044C 423 nt1.38□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YNL028WYNL028W 318 nt1.38□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.38□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YOR376WYOR376W 369 nt1.38□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 SLI15YBR156C 2097 nt1.38□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 DOP1YDR141C 5097 nt1.37□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 VPS54YDR027C 2670 nt1.37□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 SEC5YDR166C 2916 nt1.36□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 RAD9YDR217C 3930 nt1.36□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 snR8snR8 190 nt1.36□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YIR044CYIR044C 186 nt1.36□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.36□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 RPS25BYLR333C 327 nt1.36□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.36□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YDR521WYDR521W 336 nt1.35□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YBR064WYBR064W 429 nt1.35□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YBR206WYBR206W 324 nt1.35□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 YLL007CYLL007C 1998 nt1.35□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 CUL3YGR003W 2235 nt1.35□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 SLD3YGL113W 2007 nt1.34□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 PKH2YOL100W 3246 nt1.34□□□□□ -2.19
LSP1Q12230 IFH1YLR223C 3258 nt1.34□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 PDE2YOR360C 1581 nt1.34□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 ALY2YJL084C 3141 nt1.33□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 YGL052WYGL052W 306 nt1.33□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 RPS27BYHR021C 249 nt1.33□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.33□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.33□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 VAM6YDL077C 3150 nt1.33□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 SPT7YBR081C 3999 nt1.32□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 NUP188YML103C 4968 nt1.32□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 YGL041CYGL041C 204 nt1.32□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 YMR321CYMR321C 318 nt1.32□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 IES4YOR189W 351 nt1.32□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 snR49snR49 165 nt1.32□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 YCS4YLR272C 3531 nt1.31□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 EST2YLR318W 2655 nt1.31□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 YJR029WYJR029W 5268 nt1.3□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.3□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 YLR422WYLR422W 5799 nt1.3□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 PTP2YOR208W 2253 nt1.3□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 snR80snR80 171 nt1.3□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 GPG1YGL121C 381 nt1.3□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.3□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 YOR218CYOR218C 420 nt1.3□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 BEM2YER155C 6504 nt1.3□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 YDL206WYDL206W 2289 nt1.28□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 YPR092WYPR092W 306 nt1.28□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 AZF1YOR113W 2745 nt1.28□□□□□ -2.2
LSP1Q12230 NST1YNL091W 3723 nt1.28□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 SCC2YDR180W 4482 nt1.27□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.27□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 SET3YKR029C 2256 nt1.27□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 PIP2YOR363C 2991 nt1.26□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 APL3YBL037W 3078 nt1.26□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 IML1YJR138W 4755 nt1.26□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 snR74snR74 88 nt1.26□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 ABF2YMR072W 552 nt1.26□□□□□ -2.21
LSP1Q12230 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.26□□□□□ -2.21
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