Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNE2O96020 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNE2O96020 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms