Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.67□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 RFX1YLR176C 2436 nt1.67□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 LRE1YCL051W 1752 nt1.67□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 DBP6YNR038W 1890 nt1.67□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 CAT8YMR280C 4302 nt1.67□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 LYS14YDR034C 2373 nt1.66□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 SBE22YHR103W 2559 nt1.66□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 MUK1YPL070W 1839 nt1.66□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 MSH5YDL154W 2706 nt1.66□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 HTL1YCR020W-B 237 nt1.66□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 YHR210CYHR210C 1026 nt1.66□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 RPB10YOR210W 213 nt1.66□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 ZRG17YNR039C 1818 nt1.66□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 MVP1YMR004W 1536 nt1.66□□□□□ -2.14
CTF3Q12748 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.65□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 YJL135WYJL135W 318 nt1.65□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.65□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 CDC31YOR257W 486 nt1.65□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.65□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 SLY1YDR189W 2001 nt1.65□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 HMI1YOL095C 2121 nt1.64□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.64□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 YIL102CYIL102C 306 nt1.64□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 BPH1YCR032W 6504 nt1.64□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 MAK10YEL053C 2202 nt1.64□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 SPO24YPR036W-A 204 nt1.63□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 YOR019WYOR019W 2193 nt1.63□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 FRK1YPL141C 2598 nt1.63□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 ZIP1YDR285W 2628 nt1.63□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 INP2YMR163C 2118 nt1.63□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 snR72snR72 98 nt1.62□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 SRP14YDL092W 441 nt1.62□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 YIL032CYIL032C 357 nt1.62□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 PFD1YJL179W 330 nt1.62□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 UTP21YLR409C 2820 nt1.62□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 HSL1YKL101W 4557 nt1.61□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 YLL032CYLL032C 2478 nt1.61□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 CHS1YNL192W 3396 nt1.59□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 YDR366CYDR366C 399 nt1.59□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 YGR069WYGR069W 336 nt1.59□□□□□ -2.15
CTF3Q12748 snR60snR60 104 nt1.58□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 YDR344CYDR344C 444 nt1.58□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 YHL042WYHL042W 453 nt1.58□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 YPR063CYPR063C 423 nt1.58□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 YCS4YLR272C 3531 nt1.58□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 MON2YNL297C 4911 nt1.58□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 MEC1YBR136W 7107 nt1.57□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 snR8snR8 190 nt1.57□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.57□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 SDH2YLL041C 801 nt1.57□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 HUG1YML058W-A 207 nt1.57□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.57□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 KAP122YGL016W 3246 nt1.56□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 SAS3YBL052C 2496 nt1.56□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.56□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 EMC5YIL027C 426 nt1.56□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 RAD61YDR014W 1944 nt1.56□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 BST1YFL025C 3090 nt1.55□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 MLH3YPL164C 2148 nt1.55□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 VPS15YBR097W 4365 nt1.55□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 SXM1YDR395W 2835 nt1.55□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 HMRA2YCR096C 360 nt1.55□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 ALG13YGL047W 609 nt1.55□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 STF2YGR008C 255 nt1.55□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 YJL015CYJL015C 285 nt1.55□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.55□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 MSH3YCR092C 3057 nt1.55□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 NCA2YPR155C 1851 nt1.54□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 ALK1YGL021W 2283 nt1.54□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 YDL211CYDL211C 1119 nt1.53□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 SSS1YDR086C 243 nt1.53□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 OST1YJL002C 1431 nt1.53□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 YJL022WYJL022W 309 nt1.53□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 COG8YML071C 1824 nt1.53□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.53□□□□□ -2.16
CTF3Q12748 ZIP2YGL249W 2115 nt1.52□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 VPS55YJR044C 423 nt1.52□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 COF1YLL050C 432 nt1.52□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.52□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 SPT21YMR179W 2277 nt1.52□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.52□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 SCW11YGL028C 1629 nt1.51□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 DGR2YKL121W 2559 nt1.51□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.51□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 YOL160WYOL160W 342 nt1.51□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 PIP2YOR363C 2991 nt1.51□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 ENV11YGR071C 2583 nt1.51□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.5□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 LCD1YDR499W 2244 nt1.5□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.5□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 SPC98YNL126W 2541 nt1.5□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 PIG1YLR273C 1947 nt1.5□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 APL2YKL135C 2181 nt1.49□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 SPC110YDR356W 2835 nt1.49□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 SSK2YNR031C 4740 nt1.49□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 MPT5YGL178W 2580 nt1.49□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.49□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 NIP100YPL174C 2607 nt1.49□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 VIK1YPL253C 1944 nt1.48□□□□□ -2.17
CTF3Q12748 UFD2YDL190C 2886 nt1.48□□□□□ -2.17
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