Protein–RNA interactions for Protein: Q12066

NUR1, Nuclear rim protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUR1Q12066 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.91□□□□□ -2.1
NUR1Q12066 YDR344CYDR344C 444 nt1.91□□□□□ -2.1
NUR1Q12066 YIL032CYIL032C 357 nt1.91□□□□□ -2.1
NUR1Q12066 ADR1YDR216W 3972 nt1.91□□□□□ -2.1
NUR1Q12066 USO1YDL058W 5373 nt1.9□□□□□ -2.1
NUR1Q12066 SFB2YNL049C 2631 nt1.9□□□□□ -2.1
NUR1Q12066 UTP21YLR409C 2820 nt1.9□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 HMRA2YCR096C 360 nt1.9□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 SRP14YDL092W 441 nt1.9□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 YHL042WYHL042W 453 nt1.9□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 YJL135WYJL135W 318 nt1.9□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 UBR2YLR024C 5619 nt1.9□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 PUT3YKL015W 2940 nt1.89□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 COG8YML071C 1824 nt1.89□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.88□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 LCD1YDR499W 2244 nt1.88□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 YNL144CYNL144C 2223 nt1.88□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 YCS4YLR272C 3531 nt1.88□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 MAD1YGL086W 2250 nt1.87□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 PAU3YCR104W 375 nt1.87□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 YDL211CYDL211C 1119 nt1.87□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 ALG13YGL047W 609 nt1.87□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 SDH2YLL041C 801 nt1.87□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.87□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 RAD34YDR314C 2079 nt1.87□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 LRE1YCL051W 1752 nt1.87□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 KCS1YDR017C 3153 nt1.87□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 PEP1YBL017C 4740 nt1.86□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 SKI3YPR189W 4299 nt1.86□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 LHS1YKL073W 2646 nt1.86□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 SPC98YNL126W 2541 nt1.86□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 SCW11YGL028C 1629 nt1.85□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 PAU2YEL049W 363 nt1.85□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 EMC5YIL027C 426 nt1.85□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 YIR044CYIR044C 186 nt1.85□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 YCR022CYCR022C 345 nt1.84□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.84□□□□□ -2.11
NUR1Q12066 YMR045CYMR045C 5268 nt1.84□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 IRC20YLR247C 4671 nt1.83□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 SPT21YMR179W 2277 nt1.83□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 NUT1YGL151W 3399 nt1.82□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.82□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.82□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 YOR282WYOR282W 321 nt1.82□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 NOC3YLR002C 1992 nt1.81□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 YCK3YER123W 1575 nt1.81□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 snR60snR60 104 nt1.81□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 SSS1YDR086C 243 nt1.81□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 MYO2YOR326W 4725 nt1.8□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 MPT5YGL178W 2580 nt1.8□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 RAD61YDR014W 1944 nt1.8□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 TRM3YDL112W 4311 nt1.8□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 YGR069WYGR069W 336 nt1.8□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.8□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 CFT1YDR301W 4074 nt1.8□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.8□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 PKH3YDR466W 2697 nt1.79□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.79□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 RPL34BYIL052C 366 nt1.79□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 YHR210CYHR210C 1026 nt1.78□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 YJL015CYJL015C 285 nt1.78□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 YNL028WYNL028W 318 nt1.78□□□□□ -2.12
NUR1Q12066 CUL3YGR003W 2235 nt1.78□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 SPO24YPR036W-A 204 nt1.77□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 IRA1YBR140C 9279 nt1.77□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 VIK1YPL253C 1944 nt1.77□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 PTP2YOR208W 2253 nt1.77□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 CTF4YPR135W 2784 nt1.76□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 SPO75YLL005C 2607 nt1.76□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.76□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 CSE2YNR010W 450 nt1.76□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 SLI15YBR156C 2097 nt1.76□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 UFD2YDL190C 2886 nt1.76□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 RPL31AYDL075W 342 nt1.75□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 snR8snR8 190 nt1.75□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.75□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 YMR321CYMR321C 318 nt1.75□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 MEC1YBR136W 7107 nt1.74□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 INA22YIR024C 651 nt1.74□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 ALY2YJL084C 3141 nt1.73□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.73□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 VPS54YDR027C 2670 nt1.73□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 KIP1YBL063W 3336 nt1.72□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 YJL022WYJL022W 309 nt1.72□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 YCL023CYCL023C 348 nt1.72□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 KAP122YGL016W 3246 nt1.72□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 IFH1YLR223C 3258 nt1.72□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 RAD50YNL250W 3939 nt1.72□□□□□ -2.13
NUR1Q12066 COG4YPR105C 2586 nt1.71□□□□□ -2.14
NUR1Q12066 YLL007CYLL007C 1998 nt1.71□□□□□ -2.14
NUR1Q12066 YDR366CYDR366C 399 nt1.71□□□□□ -2.14
NUR1Q12066 COF1YLL050C 432 nt1.71□□□□□ -2.14
NUR1Q12066 SEC5YDR166C 2916 nt1.71□□□□□ -2.14
NUR1Q12066 YJL120WYJL120W 324 nt1.7□□□□□ -2.14
NUR1Q12066 VPS55YJR044C 423 nt1.7□□□□□ -2.14
NUR1Q12066 RPS25BYLR333C 327 nt1.7□□□□□ -2.14
NUR1Q12066 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.7□□□□□ -2.14
NUR1Q12066 NCA2YPR155C 1851 nt1.7□□□□□ -2.14
NUR1Q12066 ALK1YGL021W 2283 nt1.7□□□□□ -2.14
NUR1Q12066 RPS27BYHR021C 249 nt1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.4 ms