Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 SAS3YBL052C 2496 nt0.79□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 APL3YBL037W 3078 nt0.78□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 SDH7YDR511W 402 nt0.78□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 RPS27AYKL156W 249 nt0.78□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.78□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 IRC23YOR044W 474 nt0.78□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 SPT21YMR179W 2277 nt0.78□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 SWI6YLR182W 2412 nt0.78□□□□□ -2.28
NUP49Q02199 SPO23YBR250W 1572 nt0.78□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 PIP2YOR363C 2991 nt0.77□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YDL011CYDL011C 324 nt0.77□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 CYC7YEL039C 342 nt0.77□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.77□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.77□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.76□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 MRPL50YNR022C 420 nt0.76□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YPR117WYPR117W 7470 nt0.76□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 EFR3YMR212C 2349 nt0.75□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YDR269CYDR269C 324 nt0.75□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YIL059CYIL059C 366 nt0.75□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 HIT1YJR055W 495 nt0.75□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YKL083WYKL083W 615 nt0.75□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YAR047CYAR047C 321 nt0.75□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 RPL26AYLR344W 384 nt0.75□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 PRM3YPL192C 402 nt0.75□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 PCF11YDR228C 1881 nt0.75□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 NUT1YGL151W 3399 nt0.75□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YLL032CYLL032C 2478 nt0.75□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 RFX1YLR176C 2436 nt0.75□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YDR114CYDR114C 303 nt0.74□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.74□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YAP6YDR259C 1152 nt0.74□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YHL041WYHL041W 450 nt0.74□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 RPS24BYIL069C 408 nt0.74□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YKL063CYKL063C 504 nt0.74□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 MRPL31YKL138C 396 nt0.74□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.74□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 PIG1YLR273C 1947 nt0.74□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YGR042WYGR042W 816 nt0.73□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YLR434CYLR434C 384 nt0.73□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YNL324WYNL324W 396 nt0.73□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 NUT2YPR168W 474 nt0.73□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 SEC1YDR164C 2175 nt0.73□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 NOC3YLR002C 1992 nt0.72□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 AIM9YER080W 1884 nt0.72□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 SWF1YDR126W 1011 nt0.72□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 AGA2YGL032C 264 nt0.72□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 SDH2YLL041C 801 nt0.72□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 UPS1YLR193C 528 nt0.72□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.72□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 ISF1YMR081C 1017 nt0.72□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.72□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YPL229WYPL229W 621 nt0.72□□□□□ -2.29
NUP49Q02199 YCS4YLR272C 3531 nt0.71□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 BUD3YCL014W 4911 nt0.71□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 SLY1YDR189W 2001 nt0.71□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YER079WYER079W 633 nt0.71□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 RPB10YOR210W 213 nt0.71□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YPL185WYPL185W 396 nt0.71□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 NUP145YGL092W 3954 nt0.71□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 MPT5YGL178W 2580 nt0.71□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 SCW11YGL028C 1629 nt0.71□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 APL2YKL135C 2181 nt0.7□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 snR72snR72 98 nt0.7□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 VAR1Q0140 1197 nt0.7□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.7□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YBR285WYBR285W 435 nt0.7□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 ENV11YGR071C 2583 nt0.7□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.69□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YJL135WYJL135W 318 nt0.69□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YKL202WYKL202W 582 nt0.69□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YBR012CYBR012C 420 nt0.69□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 LEE1YPL054W 906 nt0.69□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 snR51snR51 107 nt0.69□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 SET3YKR029C 2256 nt0.68□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 PAC1YOR269W 1485 nt0.68□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 NHP2YDL208W 471 nt0.68□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 PAM16YJL104W 450 nt0.68□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 CLU1YMR012W 3834 nt0.68□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.68□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 ZIP2YGL249W 2115 nt0.68□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 NPC2YDL046W 522 nt0.67□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.67□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YOR199WYOR199W 330 nt0.67□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 FIG4YNL325C 2640 nt0.66□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YHR138CYHR138C 345 nt0.66□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.66□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 RRT1YBL048W 312 nt0.66□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 YOR053WYOR053W 342 nt0.66□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 SLD3YGL113W 2007 nt0.65□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 LCD1YDR499W 2244 nt0.65□□□□□ -2.3
NUP49Q02199 BSC3YLR465C 309 nt0.65□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YNL058CYNL058C 951 nt0.65□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YAR009CYAR009C 3591 nt0.65□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 STO1YMR125W 2586 nt0.65□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YJR003CYJR003C 1560 nt0.65□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 AIM44YPL158C 2277 nt0.64□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YDR521WYDR521W 336 nt0.64□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.64□□□□□ -2.31
NUP49Q02199 YOL160WYOL160W 342 nt0.64□□□□□ -2.31
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