Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2E1P29083 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.1 ms