Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRBV30A0A0K0K1B3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRBV30A0A0K0K1B3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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