Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 PHO80YOL001W 882 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 RPL26BYGR034W 384 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 VMA21YGR105W 234 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 GOS1YHL031C 672 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 YLR232WYLR232W 348 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 snR84snR84 550 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 BI3Q0115 1554 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 KAR3YPR141C 2190 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 IPI3YNL182C 1668 nt-0.16□□□□□ -2.43
TY1B-BRQ12193 NOP9YJL010C 2001 nt-0.16□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 LSM4YER112W 564 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 YGR164WYGR164W 336 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 SMD2YLR275W 333 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 RCN2YOR220W 798 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 RPL42BYHR141C 321 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 RPS16AYMR143W 432 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 RPL42AYNL162W 321 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 PRP5YBR237W 2550 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 RTR2YDR066C 591 nt-0.18□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 SBH1YER087C-B 249 nt-0.18□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 YJL086CYJL086C 369 nt-0.18□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 YPR170CYPR170C 336 nt-0.18□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 COX3Q0275 810 nt-0.19□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt-0.19□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt-0.19□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 NTF2YER009W 378 nt-0.19□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.19□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 PRP42YDR235W 1635 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 YDL068WYDL068W 330 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 YGR042WYGR042W 816 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 UPS1YLR193C 528 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 LCD1YDR499W 2244 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 PMP1YCR024C-A 123 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 YDR290WYDR290W 330 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 RRT1YBL048W 312 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 YPL080CYPL080C 327 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 RPL26AYLR344W 384 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 ATP15YPL271W 189 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-BRQ12193 YLR252WYLR252W 306 nt-0.23□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 HNT1YDL125C 477 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 GPG1YGL121C 381 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 COX8YLR395C 237 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 MIC19YFR011C 513 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 SBH2YER019C-A 267 nt-0.25□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 NUP82YJL061W 2142 nt-0.25□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 RCO1YMR075W 2055 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 TIM10YHR005C-A 282 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 CMS1YLR003C 876 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 REF2YDR195W 1602 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 THG1YGR024C 714 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 SPO23YBR250W 1572 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 ZIP1YDR285W 2628 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 SRP14YDL092W 441 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 snR46snR46 197 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-BRQ12193 YGL042CYGL042C 306 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 PRP21YJL203W 843 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 RUF20RUF20 443 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YNL171CYNL171C 369 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 ERV15YBR210W 429 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 ARV1YLR242C 966 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 RPS10BYMR230W 318 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 LEE1YPL054W 906 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 snR24snR24 89 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 RAD34YDR314C 2079 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 FYV10YIL097W 1551 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YKL136WYKL136W 399 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YNL150WYNL150W 408 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YOR169CYOR169C 465 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YOP1YPR028W 543 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 KAR1YNL188W 1302 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YHL042WYHL042W 453 nt-0.31□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YBR071WYBR071W 636 nt-0.31□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YNL211CYNL211C 261 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YPL225WYPL225W 441 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YCL002CYCL002C 792 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YDL152WYDL152W 366 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 HOT13YKL084W 351 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 RPS27AYKL156W 249 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 AFB1YLR040C 675 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YOL118CYOL118C 309 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YBR184WYBR184W 1572 nt-0.33□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YDR029WYDR029W 315 nt-0.33□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 PFS1YHR185C 714 nt-0.33□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt-0.33□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 RPL29YFR032C-A 180 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 YDL187CYDL187C 330 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 PET20YPL159C 762 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-BRQ12193 RSM18YER050C 417 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 YNL050CYNL050C 813 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt-0.36□□□□□ -2.47
TY1B-BRQ12193 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.36□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17 ms