Protein–RNA interactions for Protein: P53394

YPR003C, Putative sulfate transporter YPR003C, yeastyeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR003CP53394 HOP2YGL033W 657 nt2.03□□□□□ -2.08
YPR003CP53394 YGR069WYGR069W 336 nt2.03□□□□□ -2.08
YPR003CP53394 YHL042WYHL042W 453 nt2.03□□□□□ -2.08
YPR003CP53394 YIL032CYIL032C 357 nt2.03□□□□□ -2.08
YPR003CP53394 PXA2YKL188C 2562 nt2.03□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 RPH1YER169W 2391 nt2.02□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 UBR1YGR184C 5853 nt2.02□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 IRR1YIL026C 3453 nt2.02□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 SSQ1YLR369W 1974 nt2.02□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 TUS1YLR425W 3924 nt2.02□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 CFT2YLR115W 2580 nt2.02□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.02□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 CYC7YEL039C 342 nt2.02□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.02□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 MUK1YPL070W 1839 nt2.02□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 SWI5YDR146C 2130 nt2.02□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 TOR2YKL203C 7425 nt2.02□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 ATG11YPR049C 3537 nt2.01□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 MCD1YDL003W 1701 nt2.01□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 RPS17AYML024W 411 nt2.01□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 SLY1YDR189W 2001 nt2.01□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YPR097WYPR097W 3222 nt2□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 TRL1YJL087C 2484 nt2□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YDL118WYDL118W 381 nt2□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YGR265WYGR265W 411 nt2□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 TRX1YLR043C 312 nt2□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 TFC8YPL007C 1767 nt2□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 ALG13YGL047W 609 nt1.99□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YBL012CYBL012C 402 nt1.99□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.99□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YPR063CYPR063C 423 nt1.99□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 CDC60YPL160W 3273 nt1.99□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 PEP1YBL017C 4740 nt1.99□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 RAD61YDR014W 1944 nt1.98□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YDL062WYDL062W 426 nt1.98□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 SPG3YDR504C 384 nt1.98□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.98□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YLR255CYLR255C 354 nt1.98□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 GIP3YPL137C 3831 nt1.98□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YGR250CYGR250C 2346 nt1.98□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 INP2YMR163C 2118 nt1.97□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 RFX1YLR176C 2436 nt1.97□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 ELG1YOR144C 2376 nt1.97□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 COG8YML071C 1824 nt1.97□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.97□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 RPB10YOR210W 213 nt1.97□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YCL023CYCL023C 348 nt1.97□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 VPS8YAL002W 3825 nt1.97□□□□□ -2.09
YPR003CP53394 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.96□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 CYB5YNL111C 363 nt1.96□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 YDR341CYDR341C 1824 nt1.96□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 PET309YLR067C 2898 nt1.95□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 snR60snR60 104 nt1.95□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 snR49snR49 165 nt1.95□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 LYS14YDR034C 2373 nt1.95□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 NOP14YDL148C 2433 nt1.95□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 DCP2YNL118C 2913 nt1.94□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 PAU18YLL064C 363 nt1.94□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 PAU6YNR076W 363 nt1.94□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 NAM7YMR080C 2916 nt1.94□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 RGA1YOR127W 3024 nt1.94□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 MVP1YMR004W 1536 nt1.93□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 HCS1YKL017C 2052 nt1.93□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 RTT101YJL047C 2529 nt1.92□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 SCW11YGL028C 1629 nt1.92□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.92□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.92□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 YCL046WYCL046W 324 nt1.92□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 PLC1YPL268W 2610 nt1.92□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 RTT107YHR154W 3213 nt1.92□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 SYH1YPL105C 2550 nt1.92□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 ZRG17YNR039C 1818 nt1.91□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.91□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.91□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 YJL135WYJL135W 318 nt1.91□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 SDH2YLL041C 801 nt1.91□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 ZIP1YDR285W 2628 nt1.91□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 ARP7YPR034W 1434 nt1.91□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.9□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 IST2YBR086C 2841 nt1.9□□□□□ -2.1
YPR003CP53394 LCD1YDR499W 2244 nt1.9□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 MAK10YEL053C 2202 nt1.9□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 snR72snR72 98 nt1.89□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 RPL37BYDR500C 267 nt1.89□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 JLP2YMR132C 627 nt1.89□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 YLL032CYLL032C 2478 nt1.88□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 YNL028WYNL028W 318 nt1.88□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.88□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 snR80snR80 171 nt1.87□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 CDC36YDL165W 576 nt1.87□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.87□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 SPT21YMR179W 2277 nt1.87□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 CHC1YGL206C 4962 nt1.87□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.86□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 BLI1YKL061W 342 nt1.86□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 ABF2YMR072W 552 nt1.86□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.86□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 CSE2YNR010W 450 nt1.86□□□□□ -2.11
YPR003CP53394 YBR064WYBR064W 429 nt1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.8 ms