Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.08□□□□□ -2.08
PUS4P48567 GCN4YEL009C 846 nt2.08□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YGL149WYGL149W 306 nt2.08□□□□□ -2.08
PUS4P48567 PCC1YKR095W-A 267 nt2.08□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.08□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YOR093CYOR093C 4947 nt2.07□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YJL135WYJL135W 318 nt2.07□□□□□ -2.08
PUS4P48567 REV3YPL167C 4515 nt2.07□□□□□ -2.08
PUS4P48567 HMI1YOL095C 2121 nt2.06□□□□□ -2.08
PUS4P48567 HSL1YKL101W 4557 nt2.06□□□□□ -2.08
PUS4P48567 snR65snR65 100 nt2.06□□□□□ -2.08
PUS4P48567 SRP14YDL092W 441 nt2.06□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.06□□□□□ -2.08
PUS4P48567 RPL38YLR325C 237 nt2.06□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YGR250CYGR250C 2346 nt2.06□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YFL063WYFL063W 456 nt2.05□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.05□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YAR029WYAR029W 225 nt2.05□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.05□□□□□ -2.08
PUS4P48567 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.05□□□□□ -2.08
PUS4P48567 snR43snR43 209 nt2.05□□□□□ -2.08
PUS4P48567 CTR9YOL145C 3234 nt2.05□□□□□ -2.08
PUS4P48567 IRC8YJL051W 2469 nt2.05□□□□□ -2.08
PUS4P48567 NPC2YDL046W 522 nt2.04□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.04□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YGR265WYGR265W 411 nt2.04□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.04□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.04□□□□□ -2.08
PUS4P48567 DBP6YNR038W 1890 nt2.03□□□□□ -2.08
PUS4P48567 IRR1YIL026C 3453 nt2.03□□□□□ -2.08
PUS4P48567 YOR055WYOR055W 435 nt2.03□□□□□ -2.08
PUS4P48567 MSC6YOR354C 2079 nt2.03□□□□□ -2.08
PUS4P48567 PDR1YGL013C 3207 nt2.02□□□□□ -2.09
PUS4P48567 INP2YMR163C 2118 nt2.02□□□□□ -2.09
PUS4P48567 YCR022CYCR022C 345 nt2.02□□□□□ -2.09
PUS4P48567 snR72snR72 98 nt2.02□□□□□ -2.09
PUS4P48567 MGA2YIR033W 3342 nt2.02□□□□□ -2.09
PUS4P48567 MYO2YOR326W 4725 nt2.02□□□□□ -2.09
PUS4P48567 SCD5YOR329C 2619 nt2.02□□□□□ -2.09
PUS4P48567 ELG1YOR144C 2376 nt2.01□□□□□ -2.09
PUS4P48567 HIR3YJR140C 4947 nt2.01□□□□□ -2.09
PUS4P48567 VTC1YER072W 390 nt2.01□□□□□ -2.09
PUS4P48567 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.01□□□□□ -2.09
PUS4P48567 GCN2YDR283C 4980 nt2.01□□□□□ -2.09
PUS4P48567 RLM1YPL089C 2031 nt2.01□□□□□ -2.09
PUS4P48567 MVP1YMR004W 1536 nt2.01□□□□□ -2.09
PUS4P48567 YLL032CYLL032C 2478 nt2□□□□□ -2.09
PUS4P48567 SAS3YBL052C 2496 nt2□□□□□ -2.09
PUS4P48567 PAU3YCR104W 375 nt2□□□□□ -2.09
PUS4P48567 MDM20YOL076W 2391 nt2□□□□□ -2.09
PUS4P48567 SEY1YOR165W 2331 nt2□□□□□ -2.09
PUS4P48567 SEC63YOR254C 1992 nt1.99□□□□□ -2.09
PUS4P48567 AGC1YPR021C 2709 nt1.99□□□□□ -2.09
PUS4P48567 PDR8YLR266C 2106 nt1.99□□□□□ -2.09
PUS4P48567 IRC20YLR247C 4671 nt1.99□□□□□ -2.09
PUS4P48567 MLH3YPL164C 2148 nt1.99□□□□□ -2.09
PUS4P48567 RGA1YOR127W 3024 nt1.98□□□□□ -2.09
PUS4P48567 YIL102CYIL102C 306 nt1.98□□□□□ -2.09
PUS4P48567 SDH2YLL041C 801 nt1.98□□□□□ -2.09
PUS4P48567 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.98□□□□□ -2.09
PUS4P48567 SPP41YDR464W 4308 nt1.97□□□□□ -2.09
PUS4P48567 DNF3YMR162C 4971 nt1.97□□□□□ -2.09
PUS4P48567 YOR282WYOR282W 321 nt1.97□□□□□ -2.09
PUS4P48567 SCP160YJL080C 3669 nt1.96□□□□□ -2.1
PUS4P48567 HTL1YCR020W-B 237 nt1.96□□□□□ -2.1
PUS4P48567 YIL032CYIL032C 357 nt1.96□□□□□ -2.1
PUS4P48567 TRX1YLR043C 312 nt1.95□□□□□ -2.1
PUS4P48567 MSH5YDL154W 2706 nt1.95□□□□□ -2.1
PUS4P48567 FKS1YLR342W 5631 nt1.94□□□□□ -2.1
PUS4P48567 FIG2YCR089W 4830 nt1.94□□□□□ -2.1
PUS4P48567 BUD2YKL092C 3315 nt1.94□□□□□ -2.1
PUS4P48567 YLR255CYLR255C 354 nt1.94□□□□□ -2.1
PUS4P48567 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.94□□□□□ -2.1
PUS4P48567 HSH155YMR288W 2916 nt1.94□□□□□ -2.1
PUS4P48567 STE11YLR362W 2154 nt1.93□□□□□ -2.1
PUS4P48567 snR60snR60 104 nt1.93□□□□□ -2.1
PUS4P48567 UBP2YOR124C 3819 nt1.93□□□□□ -2.1
PUS4P48567 ATG9YDL149W 2994 nt1.92□□□□□ -2.1
PUS4P48567 LHS1YKL073W 2646 nt1.92□□□□□ -2.1
PUS4P48567 DGR2YKL121W 2559 nt1.92□□□□□ -2.1
PUS4P48567 ZIP2YGL249W 2115 nt1.92□□□□□ -2.1
PUS4P48567 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.92□□□□□ -2.1
PUS4P48567 YJR039WYJR039W 3366 nt1.91□□□□□ -2.1
PUS4P48567 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.91□□□□□ -2.1
PUS4P48567 VPS15YBR097W 4365 nt1.9□□□□□ -2.11
PUS4P48567 UTP21YLR409C 2820 nt1.9□□□□□ -2.11
PUS4P48567 PAU2YEL049W 363 nt1.9□□□□□ -2.11
PUS4P48567 YGR069WYGR069W 336 nt1.9□□□□□ -2.11
PUS4P48567 YHL042WYHL042W 453 nt1.9□□□□□ -2.11
PUS4P48567 YPR063CYPR063C 423 nt1.9□□□□□ -2.11
PUS4P48567 YNL144CYNL144C 2223 nt1.9□□□□□ -2.11
PUS4P48567 SEC5YDR166C 2916 nt1.89□□□□□ -2.11
PUS4P48567 YDL211CYDL211C 1119 nt1.89□□□□□ -2.11
PUS4P48567 TMA7YLR262C-A 195 nt1.89□□□□□ -2.11
PUS4P48567 SFB2YNL049C 2631 nt1.88□□□□□ -2.11
PUS4P48567 ALG13YGL047W 609 nt1.88□□□□□ -2.11
PUS4P48567 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt1.88□□□□□ -2.11
PUS4P48567 YOL160WYOL160W 342 nt1.88□□□□□ -2.11
PUS4P48567 SPT21YMR179W 2277 nt1.88□□□□□ -2.11
PUS4P48567 SSS1YDR086C 243 nt1.87□□□□□ -2.11
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