Protein–RNA interactions for Protein: P0CX20

YRF1-1, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-1P0CX20 MMS4YBR098W 2076 nt-0.05□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.05□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 RPL37AYLR185W 267 nt-0.05□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 OCA6YDR067C 675 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 MIC19YFR011C 513 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 COX3Q0275 810 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 RUF20RUF20 443 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 RPL26BYGR034W 384 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 COX8YLR395C 237 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 ERV15YBR210W 429 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 snR46snR46 197 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 PET111YMR257C 2403 nt-0.07□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 TIM8YJR135W-A 264 nt-0.08□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt-0.08□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 ATP15YPL271W 189 nt-0.08□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 RAD34YDR314C 2079 nt-0.08□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 YDR114CYDR114C 303 nt-0.09□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 PFS1YHR185C 714 nt-0.09□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 YDL068WYDL068W 330 nt-0.09□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 SBH1YER087C-B 249 nt-0.09□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 YNR077CYNR077C 255 nt-0.09□□□□□ -2.42
YRF1-1P0CX20 BIG1YHR101C 1008 nt-0.1□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 YJL086CYJL086C 369 nt-0.1□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 YNL171CYNL171C 369 nt-0.1□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 YPR153WYPR153W 423 nt-0.1□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 YPR170CYPR170C 336 nt-0.1□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 RPM2YML091C 3609 nt-0.1□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 THG1YGR024C 714 nt-0.11□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 SPO11YHL022C 1197 nt-0.11□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.11□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 snR190snR190 190 nt-0.11□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 SLD3YGL113W 2007 nt-0.11□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 PRP5YBR237W 2550 nt-0.12□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 ZIP1YDR285W 2628 nt-0.12□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 HNT1YDL125C 477 nt-0.12□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 RPC10YHR143W-A 213 nt-0.12□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 LCD1YDR499W 2244 nt-0.13□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 COX12YLR038C 252 nt-0.13□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 RPS10BYMR230W 318 nt-0.13□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 RPB10YOR210W 213 nt-0.13□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 SRP14YDL092W 441 nt-0.14□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 SSS1YDR086C 243 nt-0.14□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 UPS1YLR193C 528 nt-0.14□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 NUP82YJL061W 2142 nt-0.14□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 VMA21YGR105W 234 nt-0.14□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.15□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 YGR042WYGR042W 816 nt-0.15□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 PET20YPL159C 762 nt-0.15□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 REF2YDR195W 1602 nt-0.15□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 IPI3YNL182C 1668 nt-0.15□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.16□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 YBR184WYBR184W 1572 nt-0.16□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 snR84snR84 550 nt-0.16□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 RRT1YBL048W 312 nt-0.16□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt-0.16□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 YOL118CYOL118C 309 nt-0.16□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 YOR169CYOR169C 465 nt-0.16□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 RCN2YOR220W 798 nt-0.16□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 snR24snR24 89 nt-0.16□□□□□ -2.43
YRF1-1P0CX20 NOP9YJL010C 2001 nt-0.17□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 PRP42YDR235W 1635 nt-0.17□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 PTP2YOR208W 2253 nt-0.17□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 PMP1YCR024C-A 123 nt-0.17□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 YGL042CYGL042C 306 nt-0.17□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 RSM18YER050C 417 nt-0.18□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 ARV1YLR242C 966 nt-0.18□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 snR57snR57 88 nt-0.19□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 YPL080CYPL080C 327 nt-0.19□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 GPG1YGL121C 381 nt-0.19□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 YLR252WYLR252W 306 nt-0.19□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 YOP1YPR028W 543 nt-0.19□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt-0.2□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 INP2YMR163C 2118 nt-0.2□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 KAR1YNL188W 1302 nt-0.2□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 RPL29YFR032C-A 180 nt-0.2□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt-0.2□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 RPL26AYLR344W 384 nt-0.2□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 NTF2YER009W 378 nt-0.21□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.21□□□□□ -2.44
YRF1-1P0CX20 TIM10YHR005C-A 282 nt-0.22□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt-0.22□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 CMS1YLR003C 876 nt-0.22□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 EMC4YGL231C 573 nt-0.23□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 SPO23YBR250W 1572 nt-0.23□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 VPS63YLR261C 327 nt-0.24□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 RCO1YMR075W 2055 nt-0.25□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 POP6YGR030C 477 nt-0.25□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 HOT13YKL084W 351 nt-0.25□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 ATP20YPR020W 348 nt-0.26□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 YDL152WYDL152W 366 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 LEE1YPL054W 906 nt-0.27□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 PRP21YJL203W 843 nt-0.28□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 YKL136WYKL136W 399 nt-0.28□□□□□ -2.45
YRF1-1P0CX20 FYV10YIL097W 1551 nt-0.28□□□□□ -2.46
YRF1-1P0CX20 SBH2YER019C-A 267 nt-0.29□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32 ms