Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SIRT1Q96EB6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIRT1Q96EB6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIRT1Q96EB6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms