Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC82Q8N4S0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms