Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HIF1AQ16665 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
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