Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 RGC1YPR115W 3252 nt3.46□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 YDL118WYDL118W 381 nt3.46□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 TIM11YDR322C-A 291 nt3.46□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 STF2YGR008C 255 nt3.46□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 VMA9YCL005W-A 222 nt3.46□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 MLH2YLR035C 2088 nt3.46□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 BOI1YBL085W 2943 nt3.45□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 RPL23BYER117W 414 nt3.45□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 YCL046WYCL046W 324 nt3.45□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 SPC98YNL126W 2541 nt3.45□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 MPH1YIR002C 2982 nt3.45□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 PSK2YOL045W 3306 nt3.44□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 PXA2YKL188C 2562 nt3.44□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 YHR080CYHR080C 4038 nt3.44□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 snR43snR43 209 nt3.44□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 VPS35YJL154C 2835 nt3.44□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 SWI1YPL016W 3945 nt3.43□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 CTF4YPR135W 2784 nt3.43□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 REC8YPR007C 2043 nt3.43□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 YJL120WYJL120W 324 nt3.43□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.43□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.43□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.43□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.43□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 CMC4YMR194C-B 222 nt3.43□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 RPS8AYBL072C 603 nt3.43□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 PRP22YER013W 3438 nt3.43□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 URA2YJL130C 6645 nt3.43□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 TSC11YER093C 4293 nt3.42□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 SMC3YJL074C 3693 nt3.42□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 UBP15YMR304W 3693 nt3.42□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 FAR1YJL157C 2493 nt3.42□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 HYP2YEL034W 474 nt3.42□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 VPS34YLR240W 2628 nt3.42□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 NPR3YHL023C 3441 nt3.41□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 YLR352WYLR352W 2424 nt3.41□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 MET10YFR030W 3108 nt3.41□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 RSN1YMR266W 2862 nt3.41□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt3.41□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 ATG13YPR185W 2217 nt3.41□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 ELG1YOR144C 2376 nt3.4□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 AI2Q0055 2565 nt3.4□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 FIG4YNL325C 2640 nt3.4□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 VPH1YOR270C 2523 nt3.4□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 SOM1YEL059C-A 225 nt3.39□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 YLR149CYLR149C 2193 nt3.39□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 APE2YKL157W 2859 nt3.39□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 SOK1YDR006C 2706 nt3.39□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 DSE4YNR067C 3354 nt3.38□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 YOR019WYOR019W 2193 nt3.38□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 TCB2YNL087W 3537 nt3.38□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 NUP159YIL115C 4383 nt3.38□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 PDR3YBL005W 2931 nt3.38□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 CHO2YGR157W 2610 nt3.38□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 SLX4YLR135W 2247 nt3.38□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 XRS2YDR369C 2565 nt3.37□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt3.37□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt3.37□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 RCO1YMR075W 2055 nt3.37□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 YAT2YER024W 2772 nt3.36□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.36□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 PHD1YKL043W 1101 nt3.36□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 PAU3YCR104W 375 nt3.35□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 COS111YBR203W 2775 nt3.35□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 PSY2YNL201C 2577 nt3.35□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 SEC63YOR254C 1992 nt3.34□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 STU1YBL034C 4542 nt3.34□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt3.34□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 RPS28BYLR264W 204 nt3.34□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 RPS25BYLR333C 327 nt3.34□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 GRR1YJR090C 3456 nt3.34□□□□□ -1.87
SRF1Q12516 YIL080WYIL080W 4722 nt3.34□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 YPL216WYPL216W 3309 nt3.34□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 SEF1YBL066C 3447 nt3.33□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 YBL012CYBL012C 402 nt3.33□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 YPR022CYPR022C 3402 nt3.32□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 ROG1YGL144C 2058 nt3.32□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.32□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 GIS4YML006C 2325 nt3.32□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 HOS4YIL112W 3252 nt3.32□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 FUN30YAL019W 3396 nt3.32□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 SPT6YGR116W 4356 nt3.31□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 YCR043CYCR043C 384 nt3.31□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.31□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 PUT3YKL015W 2940 nt3.3□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 TAF1YGR274C 3201 nt3.3□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 RPL31AYDL075W 342 nt3.3□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 snR81snR81 201 nt3.3□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.3□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 FRE2YKL220C 2136 nt3.3□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 MDM1YML104C 3384 nt3.3□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 RAD26YJR035W 3258 nt3.3□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 RPH1YER169W 2391 nt3.3□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 SMY2YBR172C 2223 nt3.29□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 KAP104YBR017C 2757 nt3.29□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 YFR016CYFR016C 3702 nt3.29□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 MAK21YDR060W 3078 nt3.29□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 LYS14YDR034C 2373 nt3.29□□□□□ -1.88
SRF1Q12516 RFX1YLR176C 2436 nt3.28□□□□□ -1.89
SRF1Q12516 MSC6YOR354C 2079 nt3.28□□□□□ -1.89
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