Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 ABF2YMR072W 552 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YOL050CYOL050C 321 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YOR282WYOR282W 321 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 HDA3YPR179C 1968 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 NOT5YPR072W 1683 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YKL115CYKL115C 393 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YBR062CYBR062C 543 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 UTP10YJL109C 5310 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YJR071WYJR071W 369 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 CCE1YKL011C 1062 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 CHZ1YER030W 462 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YLR042CYLR042C 486 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 SWM2YNR004W 441 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 PIG1YLR273C 1947 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 GEP7YGL057C 864 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 GOS1YHL031C 672 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 RAD6YGL058W 519 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YCL020WYCL020W 1317 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YDL009CYDL009C 324 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 RFA3YJL173C 369 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 NOC3YLR002C 1992 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-BLQ12490 SLI15YBR156C 2097 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 RSM27YGR215W 333 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 SLM6YBR266C 453 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 GLG1YKR058W 1851 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 YGR265WYGR265W 411 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 NBP1YLR457C 960 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 ROX1YPR065W 1107 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 DBP6YNR038W 1890 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 DPB11YJL090C 2295 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 YDR290WYDR290W 330 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 YEL010WYEL010W 351 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 YMR324CYMR324C 243 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 STO1YMR125W 2586 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 LSM4YER112W 564 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 BET4YJL031C 984 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 YOR199WYOR199W 330 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 SPR2YOR214C 711 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 ISD11YER048W-A 285 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 RUF22RUF22 515 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 YDL206WYDL206W 2289 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 AIM44YPL158C 2277 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 VPS52YDR484W 1926 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 BI3Q0115 1554 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 SAG1YJR004C 1953 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 BFR2YDR299W 1605 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 SCW11YGL028C 1629 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 IMP3YHR148W 552 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 RTC6YPL183W-A 282 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 SGD1YLR336C 2700 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 NNF2YGR089W 2811 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 MKT1YNL085W 2493 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 AFR1YDR085C 1863 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 VPS74YDR372C 1038 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 SMD2YLR275W 333 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 NPR2YEL062W 1848 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 MET32YDR253C 576 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 ALG13YGL047W 609 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 CRG1YHR209W 876 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 VIK1YPL253C 1944 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 PDE2YOR360C 1581 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 SDH2YLL041C 801 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 RPS16AYMR143W 432 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 PHO80YOL001W 882 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 LOA1YPR139C 903 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-BLQ12490 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 CHS6YJL099W 2241 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 RUF20RUF20 443 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 RPL32YBL092W 393 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 ERV15YBR210W 429 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 RPS10BYMR230W 318 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 YNL171CYNL171C 369 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 YOR105WYOR105W 327 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 YPR172WYPR172W 603 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 KAR3YPR141C 2190 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 RTR2YDR066C 591 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 OCA6YDR067C 675 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 MIC19YFR011C 513 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 RPL42BYHR141C 321 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 YJL086CYJL086C 369 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 RPL42AYNL162W 321 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 ATP15YPL271W 189 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 COX8YLR395C 237 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 PXA2YKL188C 2562 nt-0.03□□□□□ -2.41
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