Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 GIS1YDR096W 2685 nt2.28□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YJL070CYJL070C 2667 nt2.28□□□□□ -2.04
HER1Q12276 SGS1YMR190C 4344 nt2.28□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.28□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YGL024WYGL024W 336 nt2.28□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.28□□□□□ -2.04
HER1Q12276 YCL023CYCL023C 348 nt2.28□□□□□ -2.04
HER1Q12276 COG8YML071C 1824 nt2.28□□□□□ -2.04
HER1Q12276 IRC8YJL051W 2469 nt2.27□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YIL032CYIL032C 357 nt2.27□□□□□ -2.05
HER1Q12276 PHS1YJL097W 654 nt2.27□□□□□ -2.05
HER1Q12276 PAM16YJL104W 450 nt2.27□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YLR053CYLR053C 327 nt2.27□□□□□ -2.05
HER1Q12276 SAR1YPL218W 573 nt2.27□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YBR277CYBR277C 402 nt2.27□□□□□ -2.05
HER1Q12276 VMA9YCL005W-A 222 nt2.27□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YLL032CYLL032C 2478 nt2.27□□□□□ -2.05
HER1Q12276 REV3YPL167C 4515 nt2.27□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YHL042WYHL042W 453 nt2.26□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.26□□□□□ -2.05
HER1Q12276 RPS27AYKL156W 249 nt2.26□□□□□ -2.05
HER1Q12276 LSM7YNL147W 348 nt2.26□□□□□ -2.05
HER1Q12276 RTC6YPL183W-A 282 nt2.26□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YBR064WYBR064W 429 nt2.26□□□□□ -2.05
HER1Q12276 MPH1YIR002C 2982 nt2.25□□□□□ -2.05
HER1Q12276 RBK1YCR036W 1002 nt2.25□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.25□□□□□ -2.05
HER1Q12276 ISD11YER048W-A 285 nt2.25□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YHL041WYHL041W 450 nt2.25□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YJL182CYJL182C 318 nt2.25□□□□□ -2.05
HER1Q12276 NCL1YBL024W 2055 nt2.24□□□□□ -2.05
HER1Q12276 DNF1YER166W 4716 nt2.24□□□□□ -2.05
HER1Q12276 RIM20YOR275C 1986 nt2.24□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YGL069CYGL069C 465 nt2.24□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YIL059CYIL059C 366 nt2.24□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.24□□□□□ -2.05
HER1Q12276 EMC6YLL014W 327 nt2.24□□□□□ -2.05
HER1Q12276 GRX8YLR364W 330 nt2.24□□□□□ -2.05
HER1Q12276 IES4YOR189W 351 nt2.24□□□□□ -2.05
HER1Q12276 PTC5YOR090C 1719 nt2.24□□□□□ -2.05
HER1Q12276 SSD1YDR293C 3753 nt2.24□□□□□ -2.05
HER1Q12276 UBP1YDL122W 2430 nt2.23□□□□□ -2.05
HER1Q12276 SCD5YOR329C 2619 nt2.23□□□□□ -2.05
HER1Q12276 PDR11YIL013C 4236 nt2.23□□□□□ -2.05
HER1Q12276 TOF1YNL273W 3717 nt2.23□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.23□□□□□ -2.05
HER1Q12276 DOT6YER088C 2013 nt2.23□□□□□ -2.05
HER1Q12276 PHO91YNR013C 2685 nt2.23□□□□□ -2.05
HER1Q12276 VTC3YPL019C 2508 nt2.22□□□□□ -2.05
HER1Q12276 UBP11YKR098C 2154 nt2.22□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.22□□□□□ -2.05
HER1Q12276 RPA34YJL148W 702 nt2.22□□□□□ -2.05
HER1Q12276 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.22□□□□□ -2.05
HER1Q12276 HHT1YBR010W 411 nt2.22□□□□□ -2.05
HER1Q12276 TAE2YPL009C 3117 nt2.22□□□□□ -2.05
HER1Q12276 SGD1YLR336C 2700 nt2.22□□□□□ -2.05
HER1Q12276 CLN3YAL040C 1743 nt2.22□□□□□ -2.05
HER1Q12276 SEC16YPL085W 6588 nt2.22□□□□□ -2.05
HER1Q12276 NPC2YDL046W 522 nt2.21□□□□□ -2.06
HER1Q12276 PFD1YJL179W 330 nt2.21□□□□□ -2.06
HER1Q12276 RPL38YLR325C 237 nt2.21□□□□□ -2.06
HER1Q12276 YPR063CYPR063C 423 nt2.21□□□□□ -2.06
HER1Q12276 GIP3YPL137C 3831 nt2.21□□□□□ -2.06
HER1Q12276 DFG16YOR030W 1860 nt2.2□□□□□ -2.06
HER1Q12276 NPR2YEL062W 1848 nt2.2□□□□□ -2.06
HER1Q12276 snR55snR55 98 nt2.2□□□□□ -2.06
HER1Q12276 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.2□□□□□ -2.06
HER1Q12276 YOL160WYOL160W 342 nt2.2□□□□□ -2.06
HER1Q12276 PAN3YKL025C 2040 nt2.2□□□□□ -2.06
HER1Q12276 RRP6YOR001W 2202 nt2.19□□□□□ -2.06
HER1Q12276 VPS35YJL154C 2835 nt2.19□□□□□ -2.06
HER1Q12276 SAP185YJL098W 3177 nt2.19□□□□□ -2.06
HER1Q12276 SOK2YMR016C 2358 nt2.19□□□□□ -2.06
HER1Q12276 YGR151CYGR151C 336 nt2.19□□□□□ -2.06
HER1Q12276 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.19□□□□□ -2.06
HER1Q12276 RRP12YPL012W 3687 nt2.19□□□□□ -2.06
HER1Q12276 MSB1YOR188W 3414 nt2.19□□□□□ -2.06
HER1Q12276 TOF2YKR010C 2316 nt2.18□□□□□ -2.06
HER1Q12276 USO1YDL058W 5373 nt2.18□□□□□ -2.06
HER1Q12276 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.18□□□□□ -2.06
HER1Q12276 IST2YBR086C 2841 nt2.18□□□□□ -2.06
HER1Q12276 HDA3YPR179C 1968 nt2.18□□□□□ -2.06
HER1Q12276 snR60snR60 104 nt2.17□□□□□ -2.06
HER1Q12276 FMP16YDR070C 282 nt2.17□□□□□ -2.06
HER1Q12276 GPG1YGL121C 381 nt2.17□□□□□ -2.06
HER1Q12276 CYB5YNL111C 363 nt2.17□□□□□ -2.06
HER1Q12276 SNC2YOR327C 348 nt2.17□□□□□ -2.06
HER1Q12276 TMN3YER113C 2121 nt2.17□□□□□ -2.06
HER1Q12276 ALK2YBL009W 2031 nt2.17□□□□□ -2.06
HER1Q12276 BNI1YNL271C 5862 nt2.17□□□□□ -2.06
HER1Q12276 SCW11YGL028C 1629 nt2.17□□□□□ -2.06
HER1Q12276 RGA1YOR127W 3024 nt2.16□□□□□ -2.06
HER1Q12276 YGR250CYGR250C 2346 nt2.16□□□□□ -2.06
HER1Q12276 PCC1YKR095W-A 267 nt2.16□□□□□ -2.06
HER1Q12276 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.16□□□□□ -2.06
HER1Q12276 YOR302WYOR302W 78 nt2.16□□□□□ -2.06
HER1Q12276 NUT2YPR168W 474 nt2.16□□□□□ -2.06
HER1Q12276 MVP1YMR004W 1536 nt2.16□□□□□ -2.06
HER1Q12276 UBP2YOR124C 3819 nt2.15□□□□□ -2.06
HER1Q12276 BFA1YJR053W 1725 nt2.15□□□□□ -2.07
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