Protein–RNA interactions for Protein: Q12270

RBD2, Rhomboid protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RBD2Q12270 YGL239CYGL239C 315 nt1.82□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.82□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 YPL229WYPL229W 621 nt1.82□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 KAP123YER110C 3342 nt1.82□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 YBP1YBR216C 2025 nt1.81□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 SYH1YPL105C 2550 nt1.81□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 YCR022CYCR022C 345 nt1.81□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.81□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 YDR341CYDR341C 1824 nt1.81□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 SOK2YMR016C 2358 nt1.81□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 UBP1YDL122W 2430 nt1.81□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 DOT6YER088C 2013 nt1.81□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 NUP170YBL079W 4509 nt1.81□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 SGD1YLR336C 2700 nt1.81□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 UBR2YLR024C 5619 nt1.8□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 TIM13YGR181W 318 nt1.8□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 NOP10YHR072W-A 177 nt1.8□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 SNC1YAL030W 354 nt1.8□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 SNC2YOR327C 348 nt1.8□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 FMP23YBR047W 528 nt1.8□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 BUB1YGR188C 3066 nt1.8□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 DIS3YOL021C 3006 nt1.8□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 VPS35YJL154C 2835 nt1.79□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 NAM7YMR080C 2916 nt1.79□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 HSK3YKL138C-A 210 nt1.79□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt1.79□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 JIP5YPR169W 1479 nt1.79□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.79□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 AIM9YER080W 1884 nt1.79□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 PKH3YDR466W 2697 nt1.79□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 LYS9YNR050C 1341 nt1.78□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.78□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 YDR008CYDR008C 351 nt1.78□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 YPR099CYPR099C 357 nt1.78□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 NUP120YKL057C 3114 nt1.78□□□□□ -2.12
RBD2Q12270 SGO1YOR073W 1773 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 PET309YLR067C 2898 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 SMD1YGR074W 441 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YHR210CYHR210C 1026 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 PHS1YJL097W 654 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 RPS27AYKL156W 249 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YOR282WYOR282W 321 nt1.77□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 VMR1YHL035C 4779 nt1.76□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 RBK1YCR036W 1002 nt1.76□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 snR65snR65 100 nt1.76□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 TMA10YLR327C 261 nt1.76□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 STE5YDR103W 2754 nt1.76□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 NOT5YPR072W 1683 nt1.76□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 NAB6YML117W 3405 nt1.76□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 PAC1YOR269W 1485 nt1.75□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 RKM1YPL208W 1752 nt1.75□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 LRE1YCL051W 1752 nt1.75□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YGL069CYGL069C 465 nt1.75□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 RPL39YJL189W 156 nt1.75□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 RPL32YBL092W 393 nt1.75□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YBR224WYBR224W 516 nt1.75□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 LHS1YKL073W 2646 nt1.75□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 PAN3YKL025C 2040 nt1.74□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YJR039WYJR039W 3366 nt1.74□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 CSN9YDR179C 489 nt1.74□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.74□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 HOP2YGL033W 657 nt1.74□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YHL041WYHL041W 450 nt1.74□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.74□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YAR029WYAR029W 225 nt1.74□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 SAR1YPL218W 573 nt1.74□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.74□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 SPO22YIL073C 2928 nt1.74□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 RTP1YMR185W 2946 nt1.74□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YDR286CYDR286C 345 nt1.73□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YDR366CYDR366C 399 nt1.73□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.73□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 TOF2YKR010C 2316 nt1.73□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 RIC1YLR039C 3171 nt1.72□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 ADR1YDR216W 3972 nt1.72□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 SNF5YBR289W 2718 nt1.72□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 RPL35AYDL191W 363 nt1.72□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.72□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 VTC1YER072W 390 nt1.72□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 BRP1YGL007W 378 nt1.72□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 TDA9YML081W 3756 nt1.72□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 TFC8YPL007C 1767 nt1.72□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 YBR184WYBR184W 1572 nt1.72□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 SKP2YNL311C 2292 nt1.71□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 MYO4YAL029C 4416 nt1.71□□□□□ -2.13
RBD2Q12270 CDC27YBL084C 2277 nt1.71□□□□□ -2.14
RBD2Q12270 PEP3YLR148W 2757 nt1.71□□□□□ -2.14
RBD2Q12270 CRM1YGR218W 3255 nt1.71□□□□□ -2.14
RBD2Q12270 SMY1YKL079W 1971 nt1.7□□□□□ -2.14
RBD2Q12270 PAU3YCR104W 375 nt1.7□□□□□ -2.14
RBD2Q12270 YFL063WYFL063W 456 nt1.7□□□□□ -2.14
RBD2Q12270 ATP7YKL016C 525 nt1.7□□□□□ -2.14
RBD2Q12270 STB4YMR019W 2850 nt1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 76.4 ms