Protein–RNA interactions for Protein: Q12116

TMS1, Membrane protein TMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMS1Q12116 YBL073WYBL073W 312 nt1.87□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 SNC2YOR327C 348 nt1.87□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 ARP7YPR034W 1434 nt1.87□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 BUD2YKL092C 3315 nt1.86□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 CDC53YDL132W 2448 nt1.86□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 BRE1YDL074C 2103 nt1.86□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 SMD1YGR074W 441 nt1.86□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 KOG1YHR186C 4674 nt1.86□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 HSK3YKL138C-A 210 nt1.86□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.86□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 YPL229WYPL229W 621 nt1.86□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 AIM9YER080W 1884 nt1.86□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 YCR022CYCR022C 345 nt1.85□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 SNC1YAL030W 354 nt1.85□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 RPS27AYKL156W 249 nt1.85□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 SNF5YBR289W 2718 nt1.85□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 YBP1YBR216C 2025 nt1.84□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 NUP120YKL057C 3114 nt1.84□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.84□□□□□ -2.11
TMS1Q12116 PHS1YJL097W 654 nt1.83□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 YPR099CYPR099C 357 nt1.83□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 RTT101YJL047C 2529 nt1.83□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 VPS35YJL154C 2835 nt1.83□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 ATG9YDL149W 2994 nt1.83□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 RBK1YCR036W 1002 nt1.82□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.82□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 FAB1YFR019W 6837 nt1.82□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 LYS9YNR050C 1341 nt1.82□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 FKS1YLR342W 5631 nt1.82□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 CRM1YGR218W 3255 nt1.81□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 NOT5YPR072W 1683 nt1.81□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 VMR1YHL035C 4779 nt1.81□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 RPL32YBL092W 393 nt1.81□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.81□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 FMP23YBR047W 528 nt1.81□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 VPH1YOR270C 2523 nt1.81□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 RIC1YLR039C 3171 nt1.81□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 PAC1YOR269W 1485 nt1.81□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 SPO22YIL073C 2928 nt1.8□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 SGO1YOR073W 1773 nt1.8□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 SMY1YKL079W 1971 nt1.8□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 PAN3YKL025C 2040 nt1.8□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 snR65snR65 100 nt1.8□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 YDL118WYDL118W 381 nt1.8□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.8□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 VPS8YAL002W 3825 nt1.8□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 RPL39YJL189W 156 nt1.8□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 YBR224WYBR224W 516 nt1.8□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.8□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 STE5YDR103W 2754 nt1.8□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 RKM1YPL208W 1752 nt1.8□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 MGA2YIR033W 3342 nt1.79□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 YDR008CYDR008C 351 nt1.79□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 YGL069CYGL069C 465 nt1.79□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 YOR282WYOR282W 321 nt1.79□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 YOR333CYOR333C 417 nt1.79□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 PDR8YLR266C 2106 nt1.79□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 TOF2YKR010C 2316 nt1.79□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 HSH155YMR288W 2916 nt1.79□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 DIS3YOL021C 3006 nt1.79□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 SEC31YDL195W 3822 nt1.78□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 GRR1YJR090C 3456 nt1.78□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 DFG16YOR030W 1860 nt1.78□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 GCN2YDR283C 4980 nt1.78□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 YBR184WYBR184W 1572 nt1.78□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 TMA7YLR262C-A 195 nt1.78□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 MNL2YLR057W 2550 nt1.78□□□□□ -2.12
TMS1Q12116 SET2YJL168C 2202 nt1.78□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 MNE1YOR350C 1992 nt1.78□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 PEP3YLR148W 2757 nt1.77□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 TRL1YJL087C 2484 nt1.77□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 CDC27YBL084C 2277 nt1.77□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 RPL35AYDL191W 363 nt1.77□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.77□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 CSN9YDR179C 489 nt1.77□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 YDR286CYDR286C 345 nt1.77□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 YHL041WYHL041W 450 nt1.77□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 YAR029WYAR029W 225 nt1.77□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 YBL012CYBL012C 402 nt1.77□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 PEP1YBL017C 4740 nt1.77□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 SEF1YBL066C 3447 nt1.76□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.76□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.76□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 MYO4YAL029C 4416 nt1.76□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 IRC20YLR247C 4671 nt1.75□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 TDA9YML081W 3756 nt1.75□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 YLR149CYLR149C 2193 nt1.75□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 HOP2YGL033W 657 nt1.75□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 YIL059CYIL059C 366 nt1.75□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 SAR1YPL218W 573 nt1.75□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 NEO1YIL048W 3456 nt1.75□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 YGL149WYGL149W 306 nt1.74□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 RPL42BYHR141C 321 nt1.74□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 RPA34YJL148W 702 nt1.74□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 RPL42AYNL162W 321 nt1.74□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.74□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.74□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 MYO2YOR326W 4725 nt1.74□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 HER1YOR227W 3741 nt1.74□□□□□ -2.13
TMS1Q12116 STB4YMR019W 2850 nt1.73□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.1 ms