Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB1P53618 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB1P53618 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB1P53618 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB1P53618 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB1P53618 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB1P53618 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB1P53618 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB1P53618 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB1P53618 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB1P53618 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPB1P53618 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPB1P53618 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPB1P53618 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPB1P53618 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB1P53618 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB1P53618 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB1P53618 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB1P53618 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB1P53618 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB1P53618 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB1P53618 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB1P53618 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB1P53618 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB1P53618 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB1P53618 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COPB1P53618 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB1P53618 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB1P53618 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB1P53618 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB1P53618 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB1P53618 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB1P53618 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPB1P53618 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPB1P53618 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms