Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXD3Q9UJU5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms