Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHA9Q7RTU4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHA9Q7RTU4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms