Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF4Q2M2E3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms