Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.58□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 PGA1YNL158W 597 nt1.58□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 TSC3YBR058C-A 243 nt1.58□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YPR039WYPR039W 336 nt1.58□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.58□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 GPX2YBR244W 489 nt1.58□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 FAB1YFR019W 6837 nt1.58□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 PEP1YBL017C 4740 nt1.58□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 ZRG8YER033C 3231 nt1.57□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 MYO2YOR326W 4725 nt1.57□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.57□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.57□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YDR509WYDR509W 348 nt1.57□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 ECL1YGR146C 636 nt1.57□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YHR125WYHR125W 306 nt1.57□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YHR210CYHR210C 1026 nt1.57□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 CDC33YOL139C 642 nt1.57□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 EGD1YPL037C 474 nt1.57□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 MNL2YLR057W 2550 nt1.57□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 LHS1YKL073W 2646 nt1.57□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YGR025WYGR025W 303 nt1.56□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 NBL1YHR199C-A 222 nt1.56□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YJL007CYJL007C 315 nt1.56□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 SEC22YLR268W 645 nt1.56□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 RUF22RUF22 515 nt1.56□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YPL205CYPL205C 345 nt1.56□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 BRR2YER172C 6492 nt1.56□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 KAR3YPR141C 2190 nt1.56□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.55□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YAR068WYAR068W 486 nt1.55□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.55□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 TIF11YMR260C 462 nt1.55□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 NOP53YPL146C 1368 nt1.55□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 LRE1YCL051W 1752 nt1.54□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 DAS1YJL149W 1992 nt1.54□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YGL024WYGL024W 336 nt1.54□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 HUR1YGL168W 333 nt1.54□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.54□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 snR13snR13 124 nt1.54□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 snR54snR54 86 nt1.54□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 SWT1YOR166C 1377 nt1.54□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 NOT5YPR072W 1683 nt1.54□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.54□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 MSH6YDR097C 3729 nt1.54□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 SLM1YIL105C 2061 nt1.54□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YLR149CYLR149C 2193 nt1.54□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 TBS1YBR150C 3285 nt1.53□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 COX1Q0045 1605 nt1.53□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 RPL31AYDL075W 342 nt1.53□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 VAR1Q0140 1197 nt1.53□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt1.53□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 MSS11YMR164C 2277 nt1.53□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 COA6YMR244C-A 315 nt1.53□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 CMC2YBL059C-A 330 nt1.53□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YPR146CYPR146C 330 nt1.53□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 SGD1YLR336C 2700 nt1.53□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YOR019WYOR019W 2193 nt1.52□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 LYS9YNR050C 1341 nt1.52□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 ATP17YDR377W 306 nt1.52□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 IES5YER092W 378 nt1.52□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 ANS1YHR126C 480 nt1.52□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 TRX1YLR043C 312 nt1.52□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YLR101CYLR101C 396 nt1.52□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 IRE1YHR079C 3348 nt1.52□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 UTP21YLR409C 2820 nt1.51□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 KIP1YBL063W 3336 nt1.51□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.51□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 CRG1YHR209W 876 nt1.51□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.51□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YBL083CYBL083C 426 nt1.51□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YBR032WYBR032W 303 nt1.51□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YSW1YBR148W 1830 nt1.51□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 HIR3YJR140C 4947 nt1.51□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 GDS1YOR355W 1569 nt1.51□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 CDC24YAL041W 2565 nt1.51□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YJR098CYJR098C 1971 nt1.5□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 CFT1YDR301W 4074 nt1.5□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YCR043CYCR043C 384 nt1.5□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.5□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 SPO24YPR036W-A 204 nt1.5□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YPR177CYPR177C 372 nt1.5□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YBR224WYBR224W 516 nt1.5□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 RTP1YMR185W 2946 nt1.5□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 MDM20YOL076W 2391 nt1.5□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YGR250CYGR250C 2346 nt1.5□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 SAC3YDR159W 3906 nt1.49□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 SMY1YKL079W 1971 nt1.49□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YER121WYER121W 345 nt1.49□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YER135CYER135C 393 nt1.49□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.49□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.49□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 NUP120YKL057C 3114 nt1.49□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 TRM3YDL112W 4311 nt1.49□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 SKI3YPR189W 4299 nt1.48□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 RBK1YCR036W 1002 nt1.48□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt1.48□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 RPS18BYML026C 441 nt1.48□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 PEP3YLR148W 2757 nt1.48□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 CTR9YOL145C 3234 nt1.48□□□□□ -2.17
PRP46Q12417 CTF4YPR135W 2784 nt1.47□□□□□ -2.17
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