Protein–RNA interactions for Protein: Q12035

FCF2, rRNA-processing protein FCF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FCF2Q12035 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.47□□□□□ -2.33
FCF2Q12035 ATG16YMR159C 453 nt0.47□□□□□ -2.33
FCF2Q12035 YMR324CYMR324C 243 nt0.47□□□□□ -2.33
FCF2Q12035 FMP23YBR047W 528 nt0.47□□□□□ -2.33
FCF2Q12035 YCL046WYCL046W 324 nt0.47□□□□□ -2.33
FCF2Q12035 PIP2YOR363C 2991 nt0.47□□□□□ -2.33
FCF2Q12035 snR83snR83 306 nt0.46□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 PAU2YEL049W 363 nt0.46□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 SMB1YER029C 591 nt0.46□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 LSO2YGR169C-A 279 nt0.46□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.46□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 SWI6YLR182W 2412 nt0.45□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 CRG1YHR209W 876 nt0.45□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 PSF2YJL072C 642 nt0.45□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 snR34snR34 203 nt0.45□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 snR44snR44 211 nt0.45□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 PRM8YGL053W 714 nt0.44□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 THG1YGR024C 714 nt0.44□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 ANS1YHR126C 480 nt0.44□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 SEC22YLR268W 645 nt0.44□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 RPL38YLR325C 237 nt0.44□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 TOF2YKR010C 2316 nt0.44□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 CDC24YAL041W 2565 nt0.44□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 SHE4YOR035C 2370 nt0.43□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 NTF2YER009W 378 nt0.43□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 RPL42BYHR141C 321 nt0.43□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 SVP26YHR181W 687 nt0.43□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.43□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 RPL42AYNL162W 321 nt0.43□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 YDL073WYDL073W 2955 nt0.42□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 CHZ1YER030W 462 nt0.42□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 MXR1YER042W 555 nt0.42□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 SNO3YFL060C 669 nt0.42□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 YGL042CYGL042C 306 nt0.42□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 YGR265WYGR265W 411 nt0.42□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 SNO2YNL334C 669 nt0.42□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 IRC14YOR135C 342 nt0.42□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.41□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.41□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.41□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.41□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.41□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.41□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 YCL020WYCL020W 1317 nt0.41□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 SGD1YLR336C 2700 nt0.41□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 PAI3YMR174C 207 nt0.41□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 YOR366WYOR366W 354 nt0.41□□□□□ -2.34
FCF2Q12035 RIM20YOR275C 1986 nt0.4□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 SRP14YDL092W 441 nt0.4□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 SWF1YDR126W 1011 nt0.4□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 VPS74YDR372C 1038 nt0.4□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 HTD2YHR067W 843 nt0.4□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 RPS7BYNL096C 573 nt0.4□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.4□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 KAR3YPR141C 2190 nt0.4□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 ATC1YDR184C 885 nt0.39□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 RSM18YER050C 417 nt0.39□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 RPL29YFR032C-A 180 nt0.39□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 PAU18YLL064C 363 nt0.39□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 SMD3YLR147C 306 nt0.39□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 PAU6YNR076W 363 nt0.39□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 NUP82YJL061W 2142 nt0.38□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 LTE1YAL024C 4308 nt0.38□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 MPT5YGL178W 2580 nt0.38□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 YDL206WYDL206W 2289 nt0.38□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 YBR184WYBR184W 1572 nt0.38□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 RMD6YEL072W 696 nt0.38□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 REF2YDR195W 1602 nt0.38□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 UBP3YER151C 2739 nt0.37□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 RUB1YDR139C 234 nt0.37□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 BMT5YIL096C 1011 nt0.37□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 YBL073WYBL073W 312 nt0.37□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 YBR032WYBR032W 303 nt0.37□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 YLL007CYLL007C 1998 nt0.37□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 GUP1YGL084C 1683 nt0.37□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.36□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 YDL196WYDL196W 330 nt0.36□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.36□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.36□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 YJL086CYJL086C 369 nt0.36□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 TIM8YJR135W-A 264 nt0.36□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 LCL2YLR104W 396 nt0.36□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 SET3YKR029C 2256 nt0.36□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 GPX1YKL026C 504 nt0.35□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 UFE1YOR075W 1041 nt0.35□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 YBR012CYBR012C 420 nt0.35□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.35□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 PXA2YKL188C 2562 nt0.34□□□□□ -2.35
FCF2Q12035 YDL068WYDL068W 330 nt0.34□□□□□ -2.36
FCF2Q12035 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.34□□□□□ -2.36
FCF2Q12035 LSM12YHR121W 564 nt0.34□□□□□ -2.36
FCF2Q12035 VPS63YLR261C 327 nt0.34□□□□□ -2.36
FCF2Q12035 FIG4YNL325C 2640 nt0.34□□□□□ -2.36
FCF2Q12035 SUS1YBR111W-A 291 nt0.34□□□□□ -2.36
FCF2Q12035 STO1YMR125W 2586 nt0.34□□□□□ -2.36
FCF2Q12035 NOC3YLR002C 1992 nt0.34□□□□□ -2.36
FCF2Q12035 PRP16YKR086W 3216 nt0.33□□□□□ -2.36
FCF2Q12035 ECM12YHR021W-A 456 nt0.33□□□□□ -2.36
FCF2Q12035 NBP1YLR457C 960 nt0.33□□□□□ -2.36
FCF2Q12035 IES4YOR189W 351 nt0.33□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.2 ms