Protein–RNA interactions for Protein: Q05947

YLR224W, F-box protein YLR224W, yeastyeast

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR224WQ05947 MOT1YPL082C 5604 nt2.72□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 STE23YLR389C 3084 nt2.72□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 PLC1YPL268W 2610 nt2.72□□□□□ -1.97
YLR224WQ05947 SWA2YDR320C 2007 nt2.71□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 SPO14YKR031C 5052 nt2.71□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 EFR3YMR212C 2349 nt2.71□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 MUK1YPL070W 1839 nt2.7□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 YTA7YGR270W 4140 nt2.7□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 ORC2YBR060C 1863 nt2.7□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 VPS35YJL154C 2835 nt2.7□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 RIX1YHR197W 2292 nt2.7□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 NMD2YHR077C 3270 nt2.69□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 SSQ1YLR369W 1974 nt2.69□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 PNC1YGL037C 651 nt2.69□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 RGM1YMR182C 636 nt2.69□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 NOP53YPL146C 1368 nt2.69□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 ROM1YGR070W 3468 nt2.69□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 TFC1YBR123C 1950 nt2.69□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 SGF11YPL047W 300 nt2.68□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 VPH1YOR270C 2523 nt2.68□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 PTC5YOR090C 1719 nt2.68□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 snR76snR76 109 nt2.67□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.67□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.67□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.67□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.67□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.67□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 YBL053WYBL053W 375 nt2.67□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.67□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 COS111YBR203W 2775 nt2.67□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 AI2Q0055 2565 nt2.67□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 UBP11YKR098C 2154 nt2.67□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 SEC7YDR170C 6030 nt2.66□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 PSY2YNL201C 2577 nt2.66□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 ENA5YDR038C 3276 nt2.66□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 INP2YMR163C 2118 nt2.65□□□□□ -1.98
YLR224WQ05947 ULI1YFR026C 510 nt2.65□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 COX14YML129C 213 nt2.65□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 VPS34YLR240W 2628 nt2.65□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 YGR067CYGR067C 2415 nt2.64□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 YLR149CYLR149C 2193 nt2.64□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 YEL043WYEL043W 2871 nt2.64□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.64□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 RPL34BYIL052C 366 nt2.64□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 YBL109WYBL109W 336 nt2.64□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 TOM1YDR457W 9807 nt2.63□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 RSN1YMR266W 2862 nt2.63□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 KSP1YHR082C 3090 nt2.63□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 ECM29YHL030W 5607 nt2.63□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 MDM1YML104C 3384 nt2.63□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 MAK21YDR060W 3078 nt2.63□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 PRP42YDR235W 1635 nt2.63□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 PFF1YBR074W 2931 nt2.63□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 SEF1YBL066C 3447 nt2.63□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 BPT1YLL015W 4680 nt2.63□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 FLO5YHR211W 3228 nt2.63□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 MPT5YGL178W 2580 nt2.62□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 RRP12YPL012W 3687 nt2.62□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 SRB8YCR081W 4284 nt2.62□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 SAP1YER047C 2694 nt2.62□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 GRR1YJR090C 3456 nt2.62□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 PXA2YKL188C 2562 nt2.62□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 SMC2YFR031C 3513 nt2.62□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 DNL4YOR005C 2835 nt2.62□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 ROG1YGL144C 2058 nt2.62□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 YLL007CYLL007C 1998 nt2.61□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 YPR089WYPR089W 2667 nt2.61□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt2.61□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 SLH1YGR271W 5904 nt2.6□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 HEH2YDR458C 1992 nt2.6□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 SNU13YEL026W 381 nt2.6□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 ECM12YHR021W-A 456 nt2.6□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 RPS22AYJL190C 393 nt2.6□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.6□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.6□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 YOR218CYOR218C 420 nt2.6□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 DYN1YKR054C 12279 nt2.6□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 YBR184WYBR184W 1572 nt2.6□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 HRD3YLR207W 2502 nt2.59□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 RPS12YOR369C 432 nt2.59□□□□□ -1.99
YLR224WQ05947 CLN3YAL040C 1743 nt2.59□□□□□ -2
YLR224WQ05947 FLO11YIR019C 4104 nt2.58□□□□□ -2
YLR224WQ05947 ECM21YBL101C 3354 nt2.58□□□□□ -2
YLR224WQ05947 PRP6YBR055C 2700 nt2.58□□□□□ -2
YLR224WQ05947 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.58□□□□□ -2
YLR224WQ05947 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.58□□□□□ -2
YLR224WQ05947 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.58□□□□□ -2
YLR224WQ05947 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.58□□□□□ -2
YLR224WQ05947 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.58□□□□□ -2
YLR224WQ05947 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.58□□□□□ -2
YLR224WQ05947 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.58□□□□□ -2
YLR224WQ05947 NOP10YHR072W-A 177 nt2.58□□□□□ -2
YLR224WQ05947 SMY1YKL079W 1971 nt2.58□□□□□ -2
YLR224WQ05947 PMP1YCR024C-A 123 nt2.57□□□□□ -2
YLR224WQ05947 FMP16YDR070C 282 nt2.57□□□□□ -2
YLR224WQ05947 YEL073CYEL073C 324 nt2.57□□□□□ -2
YLR224WQ05947 RAX2YLR084C 3663 nt2.56□□□□□ -2
YLR224WQ05947 PEP3YLR148W 2757 nt2.56□□□□□ -2
YLR224WQ05947 DSE4YNR067C 3354 nt2.56□□□□□ -2
YLR224WQ05947 AKR1YDR264C 2295 nt2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.8 ms