Protein–RNA interactions for Protein: Q05580

HEL2, E3 ubiquitin-protein ligase HEL2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEL2Q05580 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.17□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.17□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 LSM7YNL147W 348 nt2.17□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 SLM6YBR266C 453 nt2.17□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 SWT1YOR166C 1377 nt2.17□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 VPS8YAL002W 3825 nt2.17□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 UBP2YOR124C 3819 nt2.17□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 UTP22YGR090W 3714 nt2.16□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 VPH1YOR270C 2523 nt2.16□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 CDC50YCR094W 1176 nt2.16□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 YKL111CYKL111C 336 nt2.16□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 RPL40BYKR094C 387 nt2.16□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 YAF9YNL107W 681 nt2.16□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 UBR1YGR184C 5853 nt2.16□□□□□ -2.06
HEL2Q05580 NHP2YDL208W 471 nt2.15□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 DAD4YDR320C-A 219 nt2.15□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 GCN4YEL009C 846 nt2.15□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.15□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YGR035CYGR035C 351 nt2.15□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.15□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YLR031WYLR031W 561 nt2.15□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YAR068WYAR068W 486 nt2.15□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YOR146WYOR146W 306 nt2.15□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YOR199WYOR199W 330 nt2.15□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 NUP82YJL061W 2142 nt2.14□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.14□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.14□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 ADR1YDR216W 3972 nt2.14□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 HSL1YKL101W 4557 nt2.14□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 VPS52YDR484W 1926 nt2.13□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 HER1YOR227W 3741 nt2.13□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 WIP1YDR374W-A 270 nt2.13□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.13□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 ABM1YJR108W 372 nt2.13□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YNL010WYNL010W 726 nt2.13□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 CFT2YLR115W 2580 nt2.13□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 COX1Q0045 1605 nt2.13□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 ALK2YBL009W 2031 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 DIE2YGR227W 1578 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YDL068WYDL068W 330 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 MZM1YDR493W 372 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 NOP10YHR072W-A 177 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 ANS1YHR126C 480 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 URM1YIL008W 300 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 SNC1YAL030W 354 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 GRX8YLR364W 330 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YMR324CYMR324C 243 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YPL238CYPL238C 390 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 BRE1YDL074C 2103 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 GNT1YOR320C 1476 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 CAT2YML042W 2013 nt2.12□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 DFG16YOR030W 1860 nt2.11□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 LHS1YKL073W 2646 nt2.11□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YDL041WYDL041W 354 nt2.11□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 SMD1YGR074W 441 nt2.11□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.11□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 DGR1YNL130C-A 147 nt2.11□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YOR333CYOR333C 417 nt2.11□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 ROX1YPR065W 1107 nt2.11□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YSY6YBR162W-A 198 nt2.11□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 TRL1YJL087C 2484 nt2.1□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 ATP17YDR377W 306 nt2.1□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.1□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 TIM18YOR297C 579 nt2.1□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 GIP3YPL137C 3831 nt2.1□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 BFA1YJR053W 1725 nt2.1□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 FKS1YLR342W 5631 nt2.1□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 CRM1YGR218W 3255 nt2.09□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 MNE1YOR350C 1992 nt2.09□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 GRR1YJR090C 3456 nt2.09□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 YER181CYER181C 324 nt2.09□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 VOA1YGR106C 798 nt2.09□□□□□ -2.07
HEL2Q05580 CDC24YAL041W 2565 nt2.08□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 YER097WYER097W 330 nt2.08□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 YKL118WYKL118W 312 nt2.08□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 RPL26AYLR344W 384 nt2.08□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 SOK2YMR016C 2358 nt2.08□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 HCS1YKL017C 2052 nt2.08□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 YJL016WYJL016W 1686 nt2.07□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 FMP23YBR047W 528 nt2.07□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 YDR102CYDR102C 333 nt2.06□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 YDR286CYDR286C 345 nt2.06□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 YDR413CYDR413C 576 nt2.06□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 YHL037CYHL037C 402 nt2.06□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 TMA22YJR014W 597 nt2.06□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 YKL136WYKL136W 399 nt2.06□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.06□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 HCH1YNL281W 462 nt2.06□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 IRC10YOL015W 1761 nt2.05□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 LRE1YCL051W 1752 nt2.05□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 CDC60YPL160W 3273 nt2.05□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 YDL152WYDL152W 366 nt2.05□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.05□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.05□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 YJR003CYJR003C 1560 nt2.05□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 PEX8YGR077C 1770 nt2.05□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 SPO22YIL073C 2928 nt2.04□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 DIS3YOL021C 3006 nt2.04□□□□□ -2.08
HEL2Q05580 KIP1YBL063W 3336 nt2.04□□□□□ -2.08
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