Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD21O60216 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD21O60216 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD21O60216 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD21O60216 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD21O60216 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD21O60216 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD21O60216 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD21O60216 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD21O60216 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD21O60216 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD21O60216 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD21O60216 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD21O60216 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD21O60216 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD21O60216 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD21O60216 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD21O60216 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD21O60216 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD21O60216 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD21O60216 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD21O60216 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD21O60216 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD21O60216 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD21O60216 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD21O60216 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD21O60216 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD21O60216 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD21O60216 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms