Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSO14618 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSO14618 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCSO14618 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCSO14618 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCSO14618 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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