Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BHMG1C9JSJ3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BHMG1C9JSJ3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1305.8 ms